中国科学技术大学苏州高等研究院（以下简称“苏州高研院”）前身为中国科学技术大学苏州研究院，由中国科学技术大学与苏州市人民政府于2003年共建，是苏州独墅湖科教创新区最早入驻的高校之一。

2020年6月，为积极响应国家长三角一体化战略，中国科大与苏州市政府签约，在原苏州研究院基础上共建苏州高研院。高研院实行理事会领导下的院长负责制，中国科大和苏州市领导作为理事成员定期参加会议，校地双方以中国科学技术大学世界一流大学建设方案为引领，以苏州工业园区建设世界一流高科技园区为目标，建设苏州高研院。双方共同致力于将苏州高研院打造成以新兴产业发展需求为导向、具有鲜明特色、世界一流的人才培养和科学研究机构，为地方产业升级和经济社会发展贡献力量，为中国科学技术大学双一流建设提供有力支撑。苏州高研院将深化办学内涵，利用地方产业政策和地域优势， 吸引海内外高水平人才，推动相关学科的建设和发展，有针对性地为地方培养一批多层次、国际化、高素质应用型人才，深化产教融合，全面构建中国科学技术大学在苏人才培养、基础研究、技术创新、成果转化的一体化综合体。